بررسی خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی ایزوله های acidovorax avenae subsp. avenae عامل نواری باکتریائی برنج در استان های مازندران و گلستان

بیماری نوار قهوه ای گیاهچه برنج (brown stripe of rice) اولین بار توسط رحیمیان از خزانه های برنج (oryza sativa l.) استان مازندران گزارش، و عامل آن acidovorax avenae subsp. avenae (aaa) شناسائی شده است. به منظور بررسی خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی عامل نوار قهوه ای برنج، نمونه برداری، طی فصول زراعی 91-1390 از خزانه های استان مازندران انجام شد. برگهای دارای علائم نوار قهوه ای روی محیط nas کشت شدند و 90 جدایه بر اساس آزمونهای بیوشیمیائی و فیزیولوژیکی به عنوان aaa شناسائی شدند. تکثیر قطعاتی از ژن های isr و trpb توسط جدایه های نماینده و مقایسه آنها با توالی های موجود در ncbi نتایج آزمونهای بیوشیمیائی و فیزیولوژیکی در تشخیص عامل نوار قهوه ای گیاهچه های برنج، به عنوان aaa را تایید کرد. جدایه ها بر اساس ویژگیهای فنوتیپی مورد بررسی، تنوعی نداشتند و الگوی نقوش پروتئینی جدایه ها نیز اختلافات جزئی نشان داد. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه ها، واکنشهای زنجیره ای پلیمراز با روشهای rep-pcr box-, eric (rep-pcr) انجام شد. گروه بندی جدایه ها با مقایسه نقوش قطعات dna و نمره دهی بر پایه وجود یا عدم وجود قطعات همسان و با استفاده از ضریب تشابه جاکارد صورت گرفت. دندروگرام با روش مقایسه جفت ها از طریق میانگین های بی وزن (upgma) و با استفاده از نرم افزار ntsys 2.02 ترسیم گردید. مقایسه نقوش قطعات dna تکثیر شده در rep-pcr نشان داد که، در سطح تشابه 20% ، جدایه ها با آغازگرهای box ، rep و eric به ترتیب به 7 ، 5 و 2 گروه دسته بندی شدند. پیش از این اطلاعاتی در زمینه وجود چنین سطح بالایی از تنوع ژنتیکی در جمعیت های این عامل باکتریائی در ایران در دست نبوده و این اولین گزارش از وجود جمعیت های بسیار متنوع aaa در خزانه های برنج در مازندران است.